Подскажите, когда я в админ-панеле создаю баннер он появляется в самом низу сайта, возможны-ли при стандартном дизайне сайта другие места размещения баннера?

Перенесите переменную @banerDisp@ в нужное вам место в шаблонах index.tpl и shop.tpl, так же вы можете размещать рекламу (в ручном режиме)в текстовых блоках в любом месте и с привязкой к страницам. Сервис - Обзор - Текстовые блоки